Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTF1Q16619 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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