Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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