Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms