Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELOBQ15370 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ELOBQ15370 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms