Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms