Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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