Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNTB1Q13884 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNTB1Q13884 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms