Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PWP1Q13610 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PWP1Q13610 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PWP1Q13610 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PWP1Q13610 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PWP1Q13610 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PWP1Q13610 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PWP1Q13610 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PWP1Q13610 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PWP1Q13610 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PWP1Q13610 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PWP1Q13610 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PWP1Q13610 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PWP1Q13610 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PWP1Q13610 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PWP1Q13610 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PWP1Q13610 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PWP1Q13610 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PWP1Q13610 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PWP1Q13610 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PWP1Q13610 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PWP1Q13610 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PWP1Q13610 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PWP1Q13610 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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PWP1Q13610 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PWP1Q13610 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PWP1Q13610 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PWP1Q13610 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PWP1Q13610 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PWP1Q13610 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PWP1Q13610 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PWP1Q13610 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PWP1Q13610 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PWP1Q13610 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PWP1Q13610 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PWP1Q13610 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PWP1Q13610 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PWP1Q13610 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PWP1Q13610 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PWP1Q13610 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PWP1Q13610 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PWP1Q13610 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PWP1Q13610 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
PWP1Q13610 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PWP1Q13610 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PWP1Q13610 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PWP1Q13610 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PWP1Q13610 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PWP1Q13610 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PWP1Q13610 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PWP1Q13610 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PWP1Q13610 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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