Protein–RNA interactions for Protein: Q13409

DYNC1I2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I2Q13409 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DYNC1I2Q13409 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DYNC1I2Q13409 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms