Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCGQ13326 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms