Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 AUP1-206ENST00000466894 1658 ntTSL 510.01□□□□□ -0.819e-7■□□□□ 9.3
SRSF9Q13242 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.869e-7■□□□□ 9.3
SRSF9Q13242 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.899e-7■□□□□ 9.3
SRSF9Q13242 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.029e-7■□□□□ 9.3
SRSF9Q13242 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.825e-8■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.095e-8■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 CHPT1-207ENST00000552213 598 ntTSL 38.05□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 AJUBA-205ENST00000553736 751 ntTSL 212.41□□□□□ -0.422e-9■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 LUC7L2-204ENST00000456182 2411 ntTSL 1 (best)12.65□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.492e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.66e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 ANKZF1-211ENST00000463792 3245 ntTSL 211.08□□□□□ -0.642e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.666e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-207ENST00000503105 559 ntTSL 310.88□□□□□ -0.676e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 ANKZF1-218ENST00000477479 2940 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.672e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.676e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.726e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-210ENST00000504549 980 ntTSL 510.52□□□□□ -0.736e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-231ENST00000519033 832 ntTSL 310.52□□□□□ -0.736e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-205ENST00000502632 1509 ntTSL 210.48□□□□□ -0.736e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.742e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.792e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.816e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-218ENST00000510678 1996 ntTSL 59.52□□□□□ -0.896e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-224ENST00000514731 1371 ntTSL 29.2□□□□□ -0.946e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-223ENST00000514332 2444 ntTSL 29.12□□□□□ -0.956e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 LUC7L2-209ENST00000608368 551 ntTSL 48.94□□□□□ -0.982e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 ATL2-203ENST00000405384 1905 ntTSL 1 (best)8.38□□□□□ -1.072e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 ATL2-206ENST00000419554 2335 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.092e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-211ENST00000504779 792 ntTSL 58.24□□□□□ -1.096e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-206ENST00000502904 2913 ntTSL 27.75□□□□□ -1.176e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-236ENST00000519958 885 ntTSL 57.52□□□□□ -1.216e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.242e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-247ENST00000523921 584 ntTSL 27.12□□□□□ -1.276e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-239ENST00000521173 831 ntTSL 56.64□□□□□ -1.356e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.452e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 LUC7L2-205ENST00000463912 2382 ntTSL 25.15□□□□□ -1.592e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.672e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 HNRNPH1-227ENST00000515481 5564 ntTSL 24.27□□□□□ -1.736e-13■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 GMDS-207ENST00000530459 520 ntTSL 33.86□□□□□ -1.792e-8■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 LUC7L2-207ENST00000498518 2837 ntTSL 23.28□□□□□ -1.882e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.932e-6■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 CREBZF-203ENST00000525639 2850 ntTSL 513.49□□□□□ -0.251e-8■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 CREBZF-202ENST00000490820 4329 ntTSL 1 (best)12.11□□□□□ -0.471e-8■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.691e-8■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 CREBZF-201ENST00000260058 1431 ntTSL 210.43□□□□□ -0.741e-8■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 CREBZF-208ENST00000531515 724 ntTSL 38.83□□□□□ -11e-8■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.721e-8■□□□□ 9.2
SRSF9Q13242 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.589e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.49e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.399e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 CUL4A-205ENST00000463426 893 ntTSL 316.12■□□□□ 0.179e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 CUL4A-211ENST00000498562 790 ntTSL 316.03■□□□□ 0.169e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.069e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.031e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 RNF149-202ENST00000424632 2010 ntTSL 214.58□□□□□ -0.089e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 214.43□□□□□ -0.11e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.129e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.241e-11■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.269e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HIF1A-206ENST00000553999 616 ntTSL 412.68□□□□□ -0.381e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.41e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.451e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HIF1A-211ENST00000557446 559 ntTSL 512.14□□□□□ -0.471e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 NUP50-AS1-202ENST00000432502 596 ntTSL 212.11□□□□□ -0.479e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 212□□□□□ -0.491e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.581e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 511.24□□□□□ -0.611e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 511.06□□□□□ -0.641e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 AKT2-218ENST00000483166 4454 ntTSL 210.96□□□□□ -0.659e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.759e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.751e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.761e-11■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 MYO18A-213ENST00000532143 1002 ntTSL 310.01□□□□□ -0.819e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 AKT2-216ENST00000476266 3309 ntTSL 59.72□□□□□ -0.859e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 ITIH3-209ENST00000493136 2179 ntTSL 29.71□□□□□ -0.869e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.99e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 ITIH3-210ENST00000495622 920 ntTSL 59.29□□□□□ -0.929e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 SPG7-205ENST00000561945 411 ntTSL 39.06□□□□□ -0.969e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -19e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 SLC17A9-203ENST00000411611 565 ntTSL 28.68□□□□□ -1.021e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 SPG7-207ENST00000563218 654 ntTSL 58.57□□□□□ -1.049e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.049e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HIF1A-202ENST00000337138 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.121e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HIF1A-203ENST00000394997 3922 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.121e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.159e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HNRNPH3-207ENST00000480987 752 ntTSL 47.81□□□□□ -1.169e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.359e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 AP1G2-222ENST00000556152 673 ntTSL 36.51□□□□□ -1.371e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 AP1G2-230ENST00000557162 561 ntTSL 46.38□□□□□ -1.391e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.399e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 AP1G2-215ENST00000554977 569 ntTSL 46.09□□□□□ -1.431e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HNRNPH3-204ENST00000467249 566 ntTSL 25.77□□□□□ -1.499e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HNRNPH3-203ENST00000461310 648 ntTSL 55.11□□□□□ -1.599e-7■□□□□ 9.1
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