Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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FOXC1Q12948 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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FOXC1Q12948 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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FOXC1Q12948 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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FOXC1Q12948 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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FOXC1Q12948 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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FOXC1Q12948 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXC1Q12948 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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