Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 EML3-218ENST00000533165 524 ntTSL 311.23□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NDUFAF7-213ENST00000483999 711 ntTSL 511.23□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 KATNB1-210ENST00000569627 622 ntTSL 311.22□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 CSNK2B-205ENST00000465481 579 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 C19orf54-208ENST00000598352 546 ntTSL 1 (best)11.09□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ARHGEF11-204ENST00000483682 466 ntTSL 311□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 FANCA-210ENST00000563318 605 ntTSL 510.97□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 HOOK2-207ENST00000587178 748 ntTSL 310.96□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 AC073508.2-201ENST00000476049 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.665e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NMRAL1-205ENST00000572110 456 ntTSL 510.94□□□□□ -0.665e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 HBS1L-204ENST00000367826 2703 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.675e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ARMC6-212ENST00000539985 1252 ntTSL 210.86□□□□□ -0.675e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SULT1A1-208ENST00000566189 939 ntTSL 510.85□□□□□ -0.675e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 C17orf62-210ENST00000577732 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.674e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 C19orf54-209ENST00000598485 553 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.685e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SNX1-209ENST00000559961 712 ntTSL 310.78□□□□□ -0.685e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 DCTN2-212ENST00000549394 1439 ntTSL 210.72□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.694e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ST7L-203ENST00000360743 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ECH1-202ENST00000594164 677 ntTSL 310.69□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 DMAP1-213ENST00000487922 862 ntTSL 310.66□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 DMAP1-210ENST00000471829 874 ntTSL 310.66□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.715e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 TBCB-207ENST00000586868 466 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.715e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 HOOK2-215ENST00000589965 873 ntTSL 510.61□□□□□ -0.715e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SMARCC2-214ENST00000552674 3730 ntTSL 210.57□□□□□ -0.724e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 TGS1-203ENST00000523948 3159 ntTSL 1 (best)10.57□□□□□ -0.725e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 AKTIP-201ENST00000300245 2133 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.725e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ABCE1-207ENST00000507193 2146 ntTSL 1 (best)10.51□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ADGRD1-205ENST00000535015 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 CTSB-214ENST00000527243 580 ntTSL 410.45□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ARMC6-207ENST00000535758 505 ntTSL 310.43□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NMRAL1-217ENST00000576176 672 ntTSL 210.42□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 CSNK2B-208ENST00000481269 785 ntTSL 210.41□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SORL1-208ENST00000529445 616 ntTSL 210.37□□□□□ -0.755e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 STIP1-211ENST00000543847 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.755e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SMARCE1-203ENST00000377808 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.765e-6■■■■■ 39.5
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SF3A3Q12874 SNX1-202ENST00000380285 8119 ntTSL 1 (best)10.32□□□□□ -0.765e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SLC30A10-203ENST00000484079 2461 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.765e-6■■■■■ 39.5
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SF3A3Q12874 ABCE1-201ENST00000296577 3921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 210.23□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 USP11-209ENST00000488848 904 ntTSL 210.18□□□□□ -0.785e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SLC1A5-204ENST00000593713 774 ntTSL 310.16□□□□□ -0.785e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SORL1-203ENST00000524873 574 ntTSL 310.14□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 BTBD3-215ENST00000618918 4486 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 KAT2A-205ENST00000592310 596 ntTSL 310.1□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ZNF131-220ENST00000515326 1050 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 DMAP1-206ENST00000437511 957 ntTSL 310.07□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ZNF131-213ENST00000509341 572 ntTSL 510.03□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 TBCB-212ENST00000591296 399 ntTSL 310□□□□□ -0.815e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.815e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 CALR-202ENST00000586760 913 ntTSL 29.9□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NMRAL1-210ENST00000573533 756 ntTSL 29.9□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.835e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ORC1-202ENST00000371568 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.835e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 USP40-203ENST00000427112 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.835e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.835e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 BUD31-203ENST00000427499 889 ntTSL 39.78□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SMARCE1-207ENST00000469334 2128 ntTSL 59.73□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SAT1-208ENST00000487713 432 ntTSL 29.69□□□□□ -0.865e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.865e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ZNF131-212ENST00000509156 2063 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.875e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 CLCN2-216ENST00000636830 3236 ntTSL 29.63□□□□□ -0.875e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PTPN12-203ENST00000415482 2316 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 29.56□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 AC022400.3-201ENST00000399449 3810 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.895e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.895e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 MAPK13-205ENST00000490334 649 ntTSL 59.47□□□□□ -0.895e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 GRAMD4-206ENST00000456069 669 ntTSL 39.43□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 KDM6A-206ENST00000451692 671 ntTSL 39.41□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RPL38-207ENST00000534490 429 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.915e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.914e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NREP-213ENST00000507032 311 ntTSL 59.34□□□□□ -0.915e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NREP-212ENST00000505864 701 ntTSL 39.33□□□□□ -0.925e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ANKLE2-209ENST00000542374 515 ntTSL 39.26□□□□□ -0.935e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 EXOC4-204ENST00000460346 762 ntTSL 49.24□□□□□ -0.935e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 C17orf62-215ENST00000578913 563 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.944e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 C17orf62-211ENST00000577834 540 ntTSL 49.2□□□□□ -0.944e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SMARCE1-214ENST00000578112 2384 ntTSL 59.16□□□□□ -0.945e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 CTSB-212ENST00000526645 559 ntTSL 49.04□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 C17orf62-220ENST00000580560 564 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.974e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 FANCA-211ENST00000563510 633 ntTSL 58.99□□□□□ -0.975e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ABHD16A-205ENST00000471644 746 ntTSL 38.86□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PPP6R3-219ENST00000529907 826 ntTSL 58.85□□□□□ -0.994e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 HOOK2-209ENST00000588052 607 ntTSL 58.83□□□□□ -15e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SMARCB1-206ENST00000477836 660 ntTSL 28.8□□□□□ -15e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 C17orf62-233ENST00000584408 497 ntTSL 48.78□□□□□ -14e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PPTC7-202ENST00000548721 1471 ntTSL 28.77□□□□□ -1.015e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC8.73□□□□□ -1.015e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SRRT-208ENST00000469602 376 ntTSL 28.73□□□□□ -1.015e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RPL38-204ENST00000529123 576 ntTSL 28.69□□□□□ -1.025e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ABCE1-206ENST00000506506 421 ntTSL 38.62□□□□□ -1.035e-6■■■■■ 39.5
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