Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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