Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD3Q0VAK6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms