Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PIGFQ07326 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PIGFQ07326 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PIGFQ07326 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PIGFQ07326 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PIGFQ07326 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIGFQ07326 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIGFQ07326 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIGFQ07326 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIGFQ07326 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIGFQ07326 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIGFQ07326 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIGFQ07326 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIGFQ07326 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms