Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP4Q07065 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms