Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ID3Q02535 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ID3Q02535 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ID3Q02535 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ID3Q02535 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ID3Q02535 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ID3Q02535 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ID3Q02535 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ID3Q02535 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ID3Q02535 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ID3Q02535 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ID3Q02535 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ID3Q02535 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ID3Q02535 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ID3Q02535 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ID3Q02535 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ID3Q02535 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ID3Q02535 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ID3Q02535 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ID3Q02535 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ID3Q02535 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ID3Q02535 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ID3Q02535 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ID3Q02535 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ID3Q02535 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ID3Q02535 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ID3Q02535 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ID3Q02535 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ID3Q02535 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ID3Q02535 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ID3Q02535 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ID3Q02535 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ID3Q02535 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ID3Q02535 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ID3Q02535 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ID3Q02535 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ID3Q02535 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ID3Q02535 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ID3Q02535 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms