Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OC90Q02509 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OC90Q02509 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OC90Q02509 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OC90Q02509 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OC90Q02509 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OC90Q02509 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OC90Q02509 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OC90Q02509 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
OC90Q02509 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OC90Q02509 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OC90Q02509 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OC90Q02509 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OC90Q02509 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OC90Q02509 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
OC90Q02509 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OC90Q02509 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OC90Q02509 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OC90Q02509 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OC90Q02509 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OC90Q02509 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OC90Q02509 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OC90Q02509 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OC90Q02509 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
OC90Q02509 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
OC90Q02509 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OC90Q02509 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OC90Q02509 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OC90Q02509 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OC90Q02509 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OC90Q02509 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms