Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPEQ02224 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms