Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms