Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A2Q01362 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms