Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTD2P86397 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTD2P86397 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTD2P86397 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTD2P86397 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTD2P86397 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTD2P86397 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTD2P86397 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTD2P86397 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTD2P86397 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTD2P86397 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTD2P86397 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTD2P86397 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTD2P86397 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTD2P86397 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTD2P86397 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTD2P86397 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTD2P86397 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTD2P86397 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTD2P86397 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HTD2P86397 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms