Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SH3BP2P78314 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2P78314 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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