Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2MP61081 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms