Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBASH3AP57075 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms