Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELLP55199 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELLP55199 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELLP55199 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELLP55199 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELLP55199 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELLP55199 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELLP55199 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELLP55199 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELLP55199 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELLP55199 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELLP55199 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELLP55199 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELLP55199 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ELLP55199 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELLP55199 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELLP55199 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ELLP55199 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELLP55199 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ELLP55199 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ELLP55199 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELLP55199 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELLP55199 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ELLP55199 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELLP55199 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELLP55199 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELLP55199 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELLP55199 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELLP55199 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELLP55199 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELLP55199 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELLP55199 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELLP55199 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELLP55199 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELLP55199 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELLP55199 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELLP55199 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELLP55199 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELLP55199 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ELLP55199 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELLP55199 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELLP55199 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELLP55199 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELLP55199 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELLP55199 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELLP55199 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms