Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIF1P55008 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AIF1P55008 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AIF1P55008 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AIF1P55008 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AIF1P55008 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AIF1P55008 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AIF1P55008 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AIF1P55008 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AIF1P55008 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AIF1P55008 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AIF1P55008 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AIF1P55008 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AIF1P55008 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AIF1P55008 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AIF1P55008 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AIF1P55008 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AIF1P55008 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AIF1P55008 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AIF1P55008 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AIF1P55008 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AIF1P55008 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AIF1P55008 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AIF1P55008 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AIF1P55008 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AIF1P55008 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AIF1P55008 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AIF1P55008 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AIF1P55008 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AIF1P55008 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIF1P55008 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIF1P55008 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIF1P55008 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIF1P55008 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIF1P55008 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIF1P55008 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AIF1P55008 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AIF1P55008 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIF1P55008 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIF1P55008 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIF1P55008 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIF1P55008 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIF1P55008 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIF1P55008 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIF1P55008 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIF1P55008 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIF1P55008 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIF1P55008 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIF1P55008 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIF1P55008 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIF1P55008 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIF1P55008 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIF1P55008 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIF1P55008 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIF1P55008 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIF1P55008 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIF1P55008 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIF1P55008 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIF1P55008 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIF1P55008 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIF1P55008 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIF1P55008 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIF1P55008 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIF1P55008 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms