Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRRX1P54821 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRRX1P54821 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms