Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YARSP54577 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YARSP54577 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YARSP54577 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YARSP54577 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YARSP54577 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YARSP54577 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YARSP54577 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YARSP54577 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YARSP54577 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YARSP54577 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YARSP54577 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YARSP54577 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YARSP54577 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YARSP54577 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YARSP54577 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YARSP54577 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YARSP54577 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YARSP54577 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YARSP54577 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YARSP54577 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YARSP54577 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YARSP54577 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YARSP54577 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YARSP54577 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YARSP54577 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YARSP54577 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YARSP54577 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YARSP54577 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YARSP54577 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YARSP54577 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YARSP54577 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YARSP54577 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
YARSP54577 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
YARSP54577 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YARSP54577 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
YARSP54577 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
YARSP54577 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YARSP54577 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
YARSP54577 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
YARSP54577 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YARSP54577 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YARSP54577 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YARSP54577 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
YARSP54577 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YARSP54577 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
YARSP54577 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
YARSP54577 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YARSP54577 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YARSP54577 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YARSP54577 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
YARSP54577 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
YARSP54577 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YARSP54577 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms