Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIMK2P53671 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms