Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOSBP53539 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOSBP53539 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOSBP53539 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOSBP53539 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOSBP53539 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOSBP53539 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOSBP53539 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOSBP53539 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FOSBP53539 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOSBP53539 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOSBP53539 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOSBP53539 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOSBP53539 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOSBP53539 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOSBP53539 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOSBP53539 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOSBP53539 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOSBP53539 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOSBP53539 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOSBP53539 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOSBP53539 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOSBP53539 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOSBP53539 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOSBP53539 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOSBP53539 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOSBP53539 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOSBP53539 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOSBP53539 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOSBP53539 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOSBP53539 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOSBP53539 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOSBP53539 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOSBP53539 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOSBP53539 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FOSBP53539 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FOSBP53539 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOSBP53539 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOSBP53539 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOSBP53539 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOSBP53539 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOSBP53539 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOSBP53539 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOSBP53539 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOSBP53539 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOSBP53539 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOSBP53539 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FOSBP53539 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOSBP53539 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOSBP53539 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOSBP53539 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOSBP53539 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOSBP53539 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOSBP53539 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOSBP53539 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FOSBP53539 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOSBP53539 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOSBP53539 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOSBP53539 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOSBP53539 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOSBP53539 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOSBP53539 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOSBP53539 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOSBP53539 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOSBP53539 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FOSBP53539 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOSBP53539 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOSBP53539 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOSBP53539 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms