Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRCA2P51587 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRCA2P51587 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms