Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAPOLAP51003 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms