Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYB561P49447 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYB561P49447 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYB561P49447 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYB561P49447 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYB561P49447 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYB561P49447 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYB561P49447 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYB561P49447 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYB561P49447 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYB561P49447 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYB561P49447 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYB561P49447 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYB561P49447 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYB561P49447 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYB561P49447 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYB561P49447 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYB561P49447 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYB561P49447 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYB561P49447 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYB561P49447 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYB561P49447 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYB561P49447 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYB561P49447 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYB561P49447 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYB561P49447 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYB561P49447 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYB561P49447 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYB561P49447 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYB561P49447 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYB561P49447 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYB561P49447 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYB561P49447 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYB561P49447 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYB561P49447 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYB561P49447 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYB561P49447 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYB561P49447 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYB561P49447 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYB561P49447 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYB561P49447 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYB561P49447 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYB561P49447 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYB561P49447 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYB561P49447 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYB561P49447 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYB561P49447 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYB561P49447 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYB561P49447 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYB561P49447 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYB561P49447 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYB561P49447 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms