Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD2P49005 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD2P49005 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD2P49005 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD2P49005 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD2P49005 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD2P49005 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD2P49005 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD2P49005 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD2P49005 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD2P49005 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD2P49005 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD2P49005 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD2P49005 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD2P49005 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD2P49005 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD2P49005 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD2P49005 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD2P49005 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD2P49005 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD2P49005 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD2P49005 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD2P49005 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD2P49005 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD2P49005 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD2P49005 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD2P49005 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD2P49005 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD2P49005 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD2P49005 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD2P49005 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD2P49005 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD2P49005 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD2P49005 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD2P49005 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD2P49005 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD2P49005 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD2P49005 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD2P49005 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD2P49005 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD2P49005 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD2P49005 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD2P49005 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD2P49005 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD2P49005 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD2P49005 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD2P49005 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD2P49005 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD2P49005 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD2P49005 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD2P49005 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD2P49005 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD2P49005 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD2P49005 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD2P49005 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD2P49005 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD2P49005 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD2P49005 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms