Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC4P43686 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC4P43686 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms