Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THPOP40225 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THPOP40225 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
THPOP40225 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
THPOP40225 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THPOP40225 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THPOP40225 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THPOP40225 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THPOP40225 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THPOP40225 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THPOP40225 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THPOP40225 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THPOP40225 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THPOP40225 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THPOP40225 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THPOP40225 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THPOP40225 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THPOP40225 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THPOP40225 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THPOP40225 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THPOP40225 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THPOP40225 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THPOP40225 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THPOP40225 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THPOP40225 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
THPOP40225 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THPOP40225 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
THPOP40225 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THPOP40225 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THPOP40225 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THPOP40225 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THPOP40225 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THPOP40225 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THPOP40225 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THPOP40225 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
THPOP40225 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THPOP40225 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THPOP40225 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
THPOP40225 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THPOP40225 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THPOP40225 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THPOP40225 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THPOP40225 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THPOP40225 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THPOP40225 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
THPOP40225 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THPOP40225 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THPOP40225 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THPOP40225 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THPOP40225 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THPOP40225 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THPOP40225 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THPOP40225 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THPOP40225 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THPOP40225 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THPOP40225 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THPOP40225 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THPOP40225 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
THPOP40225 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THPOP40225 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THPOP40225 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THPOP40225 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THPOP40225 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THPOP40225 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THPOP40225 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THPOP40225 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THPOP40225 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THPOP40225 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THPOP40225 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THPOP40225 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THPOP40225 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THPOP40225 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms