Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN2P35609 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ACTN2P35609 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms