Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC13P31276 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms