Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PSMB9P28065 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms