Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMA3P25788 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMA3P25788 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms