Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBG1P23258 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms