Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2B1P20020 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B1P20020 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms