Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB4P17483 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB4P17483 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms