Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL3L1P16619 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3L1P16619 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms