Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI3P10071 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI3P10071 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI3P10071 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI3P10071 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI3P10071 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI3P10071 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI3P10071 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLI3P10071 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI3P10071 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI3P10071 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI3P10071 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLI3P10071 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLI3P10071 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GLI3P10071 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GLI3P10071 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI3P10071 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI3P10071 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI3P10071 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI3P10071 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI3P10071 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI3P10071 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLI3P10071 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI3P10071 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI3P10071 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI3P10071 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI3P10071 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI3P10071 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI3P10071 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI3P10071 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLI3P10071 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLI3P10071 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLI3P10071 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLI3P10071 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLI3P10071 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLI3P10071 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLI3P10071 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI3P10071 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI3P10071 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI3P10071 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI3P10071 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI3P10071 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI3P10071 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI3P10071 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI3P10071 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI3P10071 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI3P10071 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI3P10071 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI3P10071 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLI3P10071 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GLI3P10071 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GLI3P10071 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GLI3P10071 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GLI3P10071 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GLI3P10071 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GLI3P10071 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GLI3P10071 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GLI3P10071 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GLI3P10071 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GLI3P10071 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GLI3P10071 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GLI3P10071 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GLI3P10071 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GLI3P10071 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GLI3P10071 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GLI3P10071 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GLI3P10071 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GLI3P10071 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GLI3P10071 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GLI3P10071 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GLI3P10071 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GLI3P10071 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GLI3P10071 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GLI3P10071 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GLI3P10071 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GLI3P10071 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GLI3P10071 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GLI3P10071 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GLI3P10071 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GLI3P10071 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GLI3P10071 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GLI3P10071 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GLI3P10071 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GLI3P10071 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GLI3P10071 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GLI3P10071 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GLI3P10071 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms