Protein–RNA interactions for Protein: P01768

IGHV3-30, Immunoglobulin heavy variable 3-30, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30P01768 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-30P01768 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms