Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED1O96006 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms