Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD3O95983 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD3O95983 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD3O95983 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD3O95983 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD3O95983 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD3O95983 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD3O95983 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD3O95983 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD3O95983 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD3O95983 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD3O95983 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MBD3O95983 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD3O95983 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD3O95983 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD3O95983 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD3O95983 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD3O95983 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD3O95983 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD3O95983 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD3O95983 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD3O95983 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD3O95983 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MBD3O95983 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD3O95983 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD3O95983 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD3O95983 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD3O95983 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD3O95983 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD3O95983 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD3O95983 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD3O95983 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD3O95983 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD3O95983 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD3O95983 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MBD3O95983 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD3O95983 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD3O95983 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD3O95983 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD3O95983 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD3O95983 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD3O95983 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD3O95983 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD3O95983 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD3O95983 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD3O95983 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD3O95983 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD3O95983 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD3O95983 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD3O95983 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD3O95983 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD3O95983 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD3O95983 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD3O95983 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD3O95983 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD3O95983 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD3O95983 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD3O95983 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD3O95983 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD3O95983 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD3O95983 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD3O95983 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD3O95983 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD3O95983 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD3O95983 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD3O95983 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD3O95983 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD3O95983 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD3O95983 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD3O95983 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD3O95983 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD3O95983 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD3O95983 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD3O95983 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD3O95983 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD3O95983 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD3O95983 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD3O95983 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD3O95983 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD3O95983 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD3O95983 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms